GelRed核酸染料是一种具有凝胶染色特性,并被设计为替换高毒性染色剂-溴化乙锭(EB)的红色荧光核酸染色剂。
GelRed核酸染料既可用于前染(precast gel staining),也可用于后染(post gel staining)。通常后染比前染能够获得更灵敏的特性,并能排除染色剂在电泳过程中对核酸条带分离造成任何影响的可能性。
然而,前染较后染更为简单、经济,因为前染不需要额外的着色过程,并且燃料用量更少。因此,假如灵敏度和条带清晰度不成问题,前染则是一选。我们强烈建议您尝试两种染色方法,以便根据您的需要选择一选的染色方法。
使用方法:
1.胶染法(用法同EB)
(1)制胶时加入GelRed核酸染料(例如:每50mL琼脂糖溶液中加入5μL GelRed 10,000×储液,以此比例类推)。
(2)按照常规方法进行电泳。
注意事项:
此方法染色染料用量相对较少,500 μL染料大约可以做100块50 mL的胶。 由于GelRed具有良好的热稳定性,可以在热的琼脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷却。
摇晃,振荡或者翻转以保证染料充分混匀。也可以选择将GelRed储液加到琼脂糖粉末和电泳缓冲液中,然后用微波炉或其他常用方式加热以制备琼脂糖凝胶。
GelRed兼容所有常用的电泳缓冲溶液。 含有染料的预制凝胶溶液可以大量制备,并长期保存直到使用。 此方法不适合预制聚丙烯酰胺凝胶,对于聚丙烯酰胺凝胶请使用泡染法。
2.泡染法
(1)按照常规方法进行电泳。
(2)用H2O将GelRed 10,000×储液稀释约3,300倍到0.1 M NaCl中,制成3×染色液。(例如将15μL GelRed 10,000×储液和5 mL 1 M NaCl加到45 mL H2O中)。
(3)将凝胶小心地放入合适的容器中,如聚丙烯容器中,缓慢加入足量的3×染色液浸没凝胶,室温振荡染色30 min左右,染色时间根据凝胶厚度以及琼脂糖浓度不同而略有不同。对于含3.5~10%丙烯酰胺的凝胶,染色时间通常介于30 min到1 h,并随丙烯酰胺含量增加而延长。